一、检查部门

高新技术企业认定主管部门：科技、财政、税务部门，其他相关部门：环保、质量/安监、审计等部门。

二、检查要点

1、科技部门

（1）技术领域是否属于管理办法或工作指引中的领域。

（2）专利权属及专利时效确认。

（3）主要产品（服务）收入占高新收入比例是否超过50％。

（4）申报前后各期对比及与高新年报对比。

（5）申报材料各项指标核对。

2、财政部门

（1）每年定期对承担高企审计的事务所进行底稿等。风险检查，并抽选部分企业进行延伸检查 。

（2）会计师事务所行业协会自律检查。

3、税务部门

（1）申报材料与税务申报是否有冲突。

（2）高企认定税收优惠备案检查。

（3）研发费用加计扣除备案检查。

（4）其他相关税务检查。 

4、环保部门

（1）是否存在环评风险。 

（2）是否存在严重环境违法行为。

5、质量/安检部门

是否存在重大质量、重大安全事故。

6、审计部门

针对行政公职人员渎职、受贿等违法行为的延伸检查。

三、企业备查资料

1、知识产权证书

2、科技成果转化证明材料

3、研发活动证明材料

4、研发费用明细账及相关凭证

5、高新收入证明材料

6、科技人员证明材料

7、产学研合作证明材料

8、检查部门要求的其他资料